RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 RPAINQ86UA6 219 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAMENP-203ENST00000548391 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAMENP-203ENST00000548391 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAMENP-203ENST00000548391 XIRP2A4UGR9 3374 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAMENP-203ENST00000548391 MICAL3Q7RTP6 2002 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAMENP-203ENST00000548391 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LCHNA4D1U4 455 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 EPOPA6NHQ4 379 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ATG7O95352 703 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CHRNA1P02708 482 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PLA2G4DQ86XP0 818 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 AZI2Q9H6S1 392 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CERS4Q9HA82 394 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.46□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RFXAPO00287 272 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 DHX15O43143 795 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CCNE2O96020 404 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 INSRRP14616 1297 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 STAT5BP51692 787 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SPRED2Q7Z698 418 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 BICD2Q8TD16 824 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RASGRP4Q8TDF6 673 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PPM1EQ8WY54 764 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SEPT8Q92599 483 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RAD9AQ99638 391 aa13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CIITAP33076 1130 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 MGAT3Q09327 533 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PLCB4Q15147 1175 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ABHD15Q6UXT9 468 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ARNTL2Q8WYA1 636 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CUL9Q8IWT3 2517 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 EDIL3O43854 480 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 AMHP03971 560 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC26A2P50443 739 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 IGBP1P78318 339 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RSPH3Q86UC2 560 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 APBB2Q92870 758 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 UIMC1Q96RL1 719 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TRPC6Q9Y210 931 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 REV3LO60673 3130 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 POTEB3A0JP26 581 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CPLX1O14810 134 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 NLRP5P59047 1200 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 STK3Q13188 491 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 PRR16Q569H4 304 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 POTEBQ6S5H4 581 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TOP1MTQ969P6 601 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LENG9Q96B70 501 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 INSL6Q9Y581 213 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 SIP14410 1827 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 TRANK1O15050 2925 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LINC01553A4QN01 128 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 BACH1O14867 736 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LPXNO60711 386 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 DEXIO95424 95 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 GHRP10912 638 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 GRB10Q13322 594 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 LPIN1Q14693 890 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 FBXO47Q5MNV8 452 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PRAMENP-203ENST00000548391 ZNF302Q9NR11 478 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms