RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 UGCGQ16739 394 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 MCTP1Q6DN14 999 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 HSCBQ8IWL3 235 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 RIT2Q99578 217 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 GDF15Q99988 308 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 HIPK3Q9H422 1215 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SETD4Q9NVD3 440 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 VAV3Q9UKW4 847 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SAMM50Q9Y512 469 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SZT2Q5T011 3432 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 CDH23Q9H251 3354 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 WDR64B1ANS9 1081 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 H3BQV1 296 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 BACH1O14867 736 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TREHO43280 583 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 NEMFO60524 1076 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TIMP1P01033 207 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ATP4AP20648 1035 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 MCM7P33993 719 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 STAT5BP51692 787 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 CCL23P55773 120 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 CALCRLQ16602 461 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SCLYQ96I15 445 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PRO3102Q9H379 93 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 AZI2Q9H6S1 392 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ZNF302Q9NR11 478 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 DISC1Q9NRI5 854 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TRPC6Q9Y210 931 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 NOD1Q9Y239 953 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 EML1O00423 815 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PSAPP07602 524 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 CSF2RAP15509 400 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 EPHB4P54760 987 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 IGBP1P78318 339 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ADAM17P78536 824 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SPIRE1Q08AE8 756 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PPFIA1Q13136 1202 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ZNF174Q15697 407 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 GRIK4Q16099 956 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 TTC38Q5R3I4 469 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 FERMT3Q86UX7 667 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 BANK1Q8NDB2 785 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 FAM20AQ96MK3 541 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.71□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 NLRC5Q86WI3 1866 aa9.71□□□□□ -0.85
CS-211ENST00000548041 POTEB3A0JP26 581 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TMEM150BA6NC51 233 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 POTEMA6NI47 508 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TBX3O15119 743 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 ZNF862O60290 1169 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 MARCH6O60337 910 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 CKBP12277 381 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 INSRRP14616 1297 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SYT1P21579 422 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 SFNP31947 248 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TXKP42681 527 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 JAK3P52333 1124 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PRKCEQ02156 737 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 FPGSQ05932 587 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PTK7Q13308 1070 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 PPP2R5CQ13362 524 aa9.71□□□□□ -0.86
CS-211ENST00000548041 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms