RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 SEMA4AQ9H3S1 761 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MFSD1Q9H3U5 465 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 HCSTQ9UBK5 93 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 R4GN57 208 aa13.17□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 FSD2A1L4K1 749 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 FGF18O76093 207 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 APOBRQ0VD83 1088 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 PGM5Q15124 567 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 QRICH1Q2TAL8 776 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 VPS53Q5VIR6 699 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 STOX1Q6ZVD7 989 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ADGRF4Q8IZF3 695 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CDY2AQ9Y6F7 541 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CACNA1GO43497 2377 aa13.16□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 HIDE1A8MVS5 230 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CFBP00751 764 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 SEMA3FQ13275 785 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 FEZF2Q8TBJ5 459 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 TTC14Q96N46 770 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 ADAM7Q9H2U9 754 aa13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
CS-208ENST00000547298 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 NRCAMQ92823 1304 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ST3GAL2Q16842 350 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 PLPP4Q5VZY2 271 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TAF2Q6P1X5 1199 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ZBTB10Q96DT7 871 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TMX1Q9H3N1 280 aa13.14□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 WEE2P0C1S8 567 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 STAG3L1P0CL83 205 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 SCG2P13521 617 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 METTL7BQ6UX53 244 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 CYFIP1Q7L576 1253 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 CWH43Q9H720 699 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 JMJD4Q9H9V9 463 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 AAASQ9NRG9 546 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TMEM260Q9NX78 707 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.13□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 CEP250Q9BV73 2442 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ACACBO00763 2458 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 FRYLO94915 3013 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 NOP56O00567 594 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ITIH3Q06033 890 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ALX1Q15699 326 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 KANK3Q6NY19 840 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 RUBCNQ92622 972 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 FTHL17Q9BXU8 183 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 PADI3Q9ULW8 664 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 LZTS1Q9Y250 596 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 SQORQ9Y6N5 450 aa13.12□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MGEA5O60502 916 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 PLCB3Q01970 1234 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 THNSL1Q8IYQ7 743 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 SUMF1Q8NBK3 374 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 CASP10Q92851 521 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TCF25Q9BQ70 676 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TOMM22Q9NS69 142 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa13.11□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.1□□□□□ -0.31
CS-208ENST00000547298 FGAP02671 866 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms