RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 GPLD1P80108 840 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 TNFAIP2Q03169 654 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 PLAURQ03405 335 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 ITGA7Q13683 1181 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 ZFATQ9P243 1243 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.53□□□□□ -0.88
CLPB-211ENST00000542555 MYADML2A6NDP7 307 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CD4P01730 458 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 AKR1B1P15121 316 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CXCL17Q6UXB2 119 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 HFE2Q6ZVN8 426 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RETREG2Q8NC44 543 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 SLC9A7Q96T83 725 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RNF114Q9Y508 228 aa9.52□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ASB14A6NK59 587 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 PRR33A8MZF0 331 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ATP9BO43861 1147 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CA3P07451 260 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ALADP13716 330 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 GLB1P16278 677 aa9.51□□□□□ -0.89
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CLPB-211ENST00000542555 BEX3Q00994 111 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ARMCX2Q7L311 632 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CHST13Q8NET6 341 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CRBNQ96SW2 442 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 HINFPQ9BQA5 517 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CERS4Q9HA82 394 aa9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 USP17L12C9JPN9 530 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 USP17L21D6R901 530 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 F8W735 103 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RFXAPO00287 272 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 BCAR3O75815 825 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 SASH3O75995 380 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 MYOGP15173 224 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 PDE6AP16499 860 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RFC2P35250 354 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 KCNJ6P48051 423 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 SEC13P55735 322 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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CLPB-211ENST00000542555 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 TLK2Q86UE8 772 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 AACSQ86V21 672 aa9.5□□□□□ -0.89
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CLPB-211ENST00000542555 SSH3Q8TE77 659 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 STOML1Q9UBI4 398 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 RAXQ9Y2V3 346 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ATP2A1O14983 1001 aa9.49□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 CYP2D6P10635 497 aa9.49□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 MRE11P49959 708 aa9.49□□□□□ -0.89
CLPB-211ENST00000542555 ARSDP51689 593 aa9.49□□□□□ -0.89
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