RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 PTGER2P43116 358 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 SPA17Q15506 151 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CEP55Q53EZ4 464 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 LRCH2Q5VUJ6 765 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 LDHDQ86WU2 507 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC125Q86Z20 511 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 MYH10P35580 1976 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CETN3O15182 167 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 ATP8B1O43520 1251 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CTAGE8P0CG41 777 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 MYBP10242 640 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 UBXN2AP68543 259 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 KIF5AQ12840 1032 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 RINT1Q6NUQ1 792 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 RAB21Q9UL25 225 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMK1-208ENST00000538333 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ANO9A1A5B4 782 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC151A5D8V7 595 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PDXKO00764 312 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TLR2O60603 784 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TBC1D8O95759 1140 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 POLD1P28340 1107 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 B3GNT9Q6UX72 402 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 DYDC2Q96IM9 177 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF536O15090 1300 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SHTN1A0MZ66 631 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PRELPP51888 382 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 C1orf186Q6ZWK4 172 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PIGOQ8TEQ8 1089 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PNKPQ96T60 521 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 MYOZ2Q9NPC6 264 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ASTN1O14525 1302 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 POTEB2H3BUK9 544 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SASH3O75995 380 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 MUTP22033 750 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 INPP5BP32019 993 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PLA2G4AP47712 749 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 HSD17B4P51659 736 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 KCNH2Q12809 1159 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 BRD3Q15059 726 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 PJA2O43164 708 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CHMP2AO43633 222 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 AKR1B10O60218 316 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TBCAO75347 108 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ICAM1P05362 532 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ARP10275 920 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 APBA1Q02410 837 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TPH2Q8IWU9 490 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GANQ9H2C0 597 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 DEF6Q9H4E7 631 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 POLD4Q9HCU8 107 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ZBTB39O15060 712 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 CALUO43852 315 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GAS7O60861 476 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GAP43P17677 238 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 RASA3Q14644 834 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 TEPSINQ96N21 525 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms