RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.06□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.06□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TRIM17Q9Y577 477 aa4.06□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.06□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PDHXO00330 501 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 NFIBO00712 420 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 DLGAP3O95886 979 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 HLA-DOAP06340 250 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ATP5JP18859 108 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 HOXD10P28358 340 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CAP2P40123 477 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PRKCQQ04759 706 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 MOGSQ13724 837 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 IKBKEQ14164 716 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 KIF22Q14807 665 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 C17orf99Q6UX52 265 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TMC7Q7Z402 723 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CERS3Q8IU89 383 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 NETO1Q8TDF5 533 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CCDC74AQ96AQ1 378 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 USP26Q9BXU7 913 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 LRRCC1Q9C099 1032 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 BCL11AQ9H165 835 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ANTXR1Q9H6X2 564 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CPA4Q9UI42 421 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PALD1Q9ULE6 856 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 THSD7BQ9C0I4 1608 aa4.05□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 RFX7Q2KHR2 1363 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 FLT1P17948 1338 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TRIM75PA6NK02 468 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 GOLIM4O00461 696 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TREHO43280 583 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 NFICP08651 508 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 C1QTNF9P0C862 333 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CYP2C8P10632 490 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PDE6AP16499 860 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 MAPK8P45983 427 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PRMT2P55345 433 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SOX10P56693 466 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CAP1Q01518 475 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SPP2Q13103 211 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ORC1Q13415 861 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TTC6Q86TZ1 520 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ASB16Q96NS5 453 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 WDR18Q9BV38 432 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 DCTPP1Q9H773 170 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 AS3MTQ9HBK9 375 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 GINM1Q9NU53 330 aa4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CACNA1FO60840 1977 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 A0A096LPE4 126 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 A0A1W2PP55 124 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 A0A1W2PPZ6 126 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 C19orf81C9J6K1 198 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 GPR182O15218 404 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PSPNO60542 156 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ASNSP08243 561 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ADD2P35612 726 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PSMC4P43686 418 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 FCGRTP55899 365 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 BACE1P56817 501 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa4.03□□□□□ -1.76
TTC17-211ENST00000530483 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms