RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 AZI2Q9H6S1 392 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CDH23Q9H251 3354 aa16■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 COL6A3P12111 3177 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 MSH4O15457 936 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CTSHP09668 335 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 RSPH10BP0C881 870 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 RABGGTBP53611 331 aa15.99■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.99■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.99■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.99■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 TDP2O95551 362 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 GJA10Q969M2 543 aa15.98■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa15.98■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM265A0A087WTH1 108 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CAND2O75155 1236 aa15.97■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 XBP1P17861 261 aa15.97■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 INF2Q27J81 1249 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 Q4G0T1 1027 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa15.97■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 SLC5A5Q92911 643 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 SCN5AQ14524 2016 aa15.97■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 TET1Q8NFU7 2136 aa15.97■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 RRN3P2A6NIE6 340 aa15.96■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 KRT76Q01546 638 aa15.96■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.96■□□□□ 0.15
PDGFRB-202ENST00000517488 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.96■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 MBOAT7Q96N66 472 aa15.96■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.96■□□□□ 0.15
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PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CHRNA1P02708 482 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC26A2P50443 739 aa15.95■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 LETM2Q2VYF4 491 aa15.95■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC83Q8IWF9 413 aa15.95■□□□□ 0.14
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PDGFRB-202ENST00000517488 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ATP8B4Q8TF62 1192 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC9A7Q96T83 725 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 RIT2Q99578 217 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 FAM205CA6NFA0 338 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 WDR64B1ANS9 1081 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC37A4O43826 429 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 HBP1O60381 514 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 GAS7O60861 476 aa15.94■□□□□ 0.14
PDGFRB-202ENST00000517488 PSMD10O75832 226 aa15.94■□□□□ 0.14
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