RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	GAS7	O60861	476 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	COBL	O75128	1261 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLITRK3	O94933	977 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EYA4	O95677	639 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	FCER1A	P12319	257 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP11B2	P19099	503 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	NF2	P35240	595 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PBX1	P40424	430 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC12A3	P55017	1021 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PSMC6	P62333	389 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRMP	Q12912	555 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARID5B	Q14865	1188 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PGM5	Q15124	567 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPHA7	Q15375	998 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPR162	Q16538	588 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARSH	Q5FYA8	562 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CENPP	Q6IPU0	288 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TTI2	Q6NXR4	508 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	DYM	Q7RTS9	669 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMC6	Q7Z403	805 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERO1B	Q86YB8	467 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	IL31RA	Q8NI17	732 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	NEK9	Q8TD19	979 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	P2RX5	Q93086	422 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	UIMC1	Q96RL1	719 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EPAS1	Q99814	870 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	THAP9	Q9H5L6	903 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ELP3	Q9H9T3	547 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PXMP2	Q9NR77	195 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PANK4	Q9NVE7	773 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		5	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	RLF	Q13129	1914 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MAFG	O15525	162 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TEX33	O43247	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	IDE	P14735	1019 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNJ6	P48051	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCZ1B	P86790	482 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	COASY	Q13057	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPIL2	Q13356	520 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTMR1	Q13613	665 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	MOGS	Q13724	837 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	GIT2	Q14161	759 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRT31	Q15323	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATP2C1-223	ENST00000515854	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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