RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 BACE1P56817 501 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NEK9Q8TD19 979 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ZBED4O75132 1171 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 HOXD13P35453 343 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NACC1Q96RE7 527 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 EPHB6O15197 1021 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 MYBP10242 640 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PTPRAP18433 802 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ADAM9Q13443 819 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 WRNIP1Q96S55 665 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 MMRN2Q9H8L6 949 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PICK1Q9NRD5 415 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PDXKO00764 312 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CETN3O15182 167 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.24■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ELF2Q15723 593 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF662Q6ZS27 426 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 KCND2Q9NZV8 630 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 FAM184BQ9ULE4 1060 aa25.23■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 VWA5AO00534 786 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ERCC3P19447 782 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NR2F2P24468 414 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 HERVK_113P62684 666 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 KRT83P78385 493 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 KCNMA1Q12791 1236 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 TKFCQ3LXA3 575 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 C12orf42Q96LP6 360 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 FAM13AO94988 1023 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 NEK11Q8NG66 645 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ATG4CQ96DT6 458 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 LXNQ9BS40 222 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 JADE2Q9NQC1 790 aa25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ABL1P00519 1130 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 MNS1Q8NEH6 495 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 CARD6Q9BX69 1037 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB39O15060 712 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 GCNT3O95395 438 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 BAP1Q92560 729 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 SEL1LQ9UBV2 794 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 RLFQ13129 1914 aa25.21■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 ASTN1O14525 1302 aa25.2■■□□□ 1.63
PDE4D-223ENST00000515011 TADA3O75528 432 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ZNF131P52739 623 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 MIER3Q7Z3K6 550 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 SLC35F6Q8N357 371 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 GGA3Q9NZ52 723 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PGM5Q15124 567 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 PARVGQ9HBI0 331 aa25.2■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PDE4D-223ENST00000515011 UTRNP46939 3433 aa25.19■■□□□ 1.62
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