RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 INTS13Q9NVM9 706 aa8.1□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.1□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 RAB21Q9UL25 225 aa8.1□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.1□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.1□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 TRIOO75962 3097 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 UMODL1Q5DID0 1318 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 MAP2K7O14733 419 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 SEPT4O43236 478 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 GPAA1O43292 621 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 RPS6KA5O75582 802 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 BMP15O95972 392 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 ATP1A3P13637 1013 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 ITGA6P23229 1130 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 TXLNAP40222 546 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 HERVK_113P62684 666 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 SEMA3FQ13275 785 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 TRIM29Q14134 588 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 NR1I3Q14994 352 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 PKN1Q16512 942 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC24Q50LG9 513 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 APOA5Q6Q788 366 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 CEP112Q8N8E3 955 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 TC2NQ8N9U0 490 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 CNNM3Q8NE01 707 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 XAGE2Q96GT9 111 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 TOX2Q96NM4 488 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 CARD6Q9BX69 1037 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 FANCLQ9NW38 375 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.09□□□□□ -1.11
SMIM20-202ENST00000514384 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 TRANK1O15050 2925 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 MYH7P12883 1935 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 A0A087WWV3 80 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 BIN1O00499 593 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 LCE2BO14633 110 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 FANCGO15287 622 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB43O43298 467 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 GDF9O60383 454 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC175P0C221 793 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 PBX1P40424 430 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 PLCD1P51178 756 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 CCL23P55773 120 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 POSTNQ15063 836 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 LONRF3Q496Y0 759 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 GORABQ5T7V8 394 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 TMTC2Q8N394 836 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 FUT8Q9BYC5 575 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 GBP3Q9H0R5 595 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 RAI14Q9P0K7 980 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 USP24Q9UPU5 2620 aa8.08□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 FAM196BA6NMK8 535 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 IGSF3O75054 1194 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 MMP1P03956 469 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 BMP6P22004 513 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 GNG11P61952 73 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 PNOCQ13519 176 aa8.07□□□□□ -1.12
SMIM20-202ENST00000514384 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms