RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TMEM192Q8IY95 271 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 ANO3Q9BYT9 981 aa19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
HERC3-211ENST00000513325 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 SMCO2A6NFE2 343 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8AA7E2F4 631 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8BA8MQT2 603 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 H3BNC9 293 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FOSP01100 380 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ADCY7P51828 1080 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 PTPROQ16827 1216 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CEP55Q53EZ4 464 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FBXO47Q5MNV8 452 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 IL17RAQ96F46 866 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 SDF4Q9BRK5 362 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 AZI2Q9H6S1 392 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TMEM260Q9NX78 707 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 NCOR1O75376 2440 aa19.33■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 NFASCO94856 1347 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RRN3P2A6NIE6 340 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ENPP3O14638 875 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CDC45O75419 566 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CDC27P30260 824 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ACTR2P61160 394 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 KRT32Q14532 448 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 BARHL2Q9NY43 387 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TRPC6Q9Y210 931 aa19.32■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 COL4A6Q14031 1691 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 hCG_1984214I3L0E3 225 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 KCNA5P22460 613 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 PLCB4Q15147 1175 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FIBCD1Q8N539 461 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 MEIS1O00470 390 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ZNF76P36508 570 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 SREBF1P36956 1147 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 STAT5BP51692 787 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FGD1P98174 961 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TMEM62Q0P6H9 643 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 AP3B2Q13367 1082 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TIGD5Q53EQ6 642 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 IER5Q5VY09 327 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 BANK1Q8NDB2 785 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 EPHX3Q9H6B9 360 aa19.3■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ATG7O95352 703 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CPA1P15085 419 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CD52P31358 61 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ADD1P35611 737 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CLK2P49760 499 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RCAN1P53805 252 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 GLT8D2Q9H1C3 349 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa19.29■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 BDP1A6H8Y1 2624 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CCNE2O96020 404 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 LINC00271P0C7V0 271 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CTNNB1P35222 781 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TCEAL5Q5H9L2 206 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 CD320Q9NPF0 282 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 TRPV2Q9Y5S1 764 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 SQORQ9Y6N5 450 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 BRWD1Q9NSI6 2320 aa19.28■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 POTEB3A0JP26 581 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FAM86B1E9PN63 330 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 C5orf67F2Z3F1 127 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 M0QZ92 97 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 RB1P06400 928 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 FAM86B2P0C5J1 330 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 BMPR1AP36894 532 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 APOBRQ0VD83 1088 aa19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HERC3-211ENST00000513325 POTEBQ6S5H4 581 aa19.27■□□□□ 0.68
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