RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF2Q6P1X5 1199 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPH3Q86UC2 560 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD9AQ99638 391 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPC6Q9Y210 931 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCHNA4D1U4 455 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS3O15072 1205 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAT5BP51692 787 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM26DQ5JW98 314 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BICD2Q8TD16 824 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM6Q9NQX0 595 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRN3P2A6NIE6 340 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM86B1E9PN63 330 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP3A4P08684 503 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INSRRP14616 1297 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UIMC1Q96RL1 719 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPOPA6NHQ4 379 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRNA1P02708 482 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPAINQ86UA6 219 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPLX1O14810 134 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLCB4Q15147 1175 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APBB2Q92870 758 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BACH1O14867 736 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATG7O95352 703 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STK3Q13188 491 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPRED2Q7Z698 418 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INSL6Q9Y581 213 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTEB3A0JP26 581 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCNE2O96020 404 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GHRP10912 638 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NLRP5P59047 1200 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POTEBQ6S5H4 581 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTUS1Q9ULD2 1270 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTCH2Q9Y6C9 303 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UPP2O95045 317 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC26A2P50443 739 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETQ01105 290 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR16Q569H4 304 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABHD15Q6UXT9 468 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D22BQ9NU19 505 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THEGQ9P2T0 379 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRANK1O15050 2925 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC01553A4QN01 128 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MGAT3Q09327 533 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRB10Q13322 594 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF302Q9NR11 478 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LPIN1Q14693 890 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TJAP1Q5JTD0 557 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IER5Q5VY09 327 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT40Q6A162 431 aa26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms