RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TDP2O95551 362 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PFKMP08237 780 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTSHP09668 335 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 XBP1P17861 261 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DNAJB2P25686 324 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HOXC8P31273 242 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CIITAP33076 1130 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STAT5BP51692 787 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPNMBQ14956 572 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GRIK4Q16099 956 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 INF2Q27J81 1249 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GALNT17Q6IS24 598 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RUFY4Q6ZNE9 571 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC83Q8IWF9 413 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OXER1Q8TDS5 423 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WASF1Q92558 559 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GJA10Q969M2 543 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LENG9Q96B70 501 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TET1Q8NFU7 2136 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GBF1Q92538 1859 aa13.72□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NRCAMQ92823 1304 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MSH4O15457 936 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ST18O60284 1047 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATG7O95352 703 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACTN1P12814 892 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 INSRRP14616 1297 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USP11P51784 963 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RABGGTBP53611 331 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RBL2Q08999 1139 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MBTPS1Q14703 1052 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLCB4Q15147 1175 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCTN1Q2MV58 587 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRAF7Q6Q0C0 670 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABHD15Q6UXT9 468 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.71□□□□□ -0.21
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RSPH10B2B2RC85 870 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CHMP2AO43633 222 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RSPH10BP0C881 870 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MCM2P49736 904 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADAM17P78536 824 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LETM2Q2VYF4 491 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM160B1Q5W0V3 765 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SNX21Q969T3 373 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PBX4Q9BYU1 374 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 OSBPL7Q9BZF2 842 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF302Q9NR11 478 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SAMM50Q9Y512 469 aa13.7□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POTEB3A0JP26 581 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM205CA6NFA0 338 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GAS7O60861 476 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYOGP15173 224 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRT2P35908 639 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GUCY1B3Q02153 619 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NR5A1Q13285 461 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 POTEBQ6S5H4 581 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CKAP2LQ8IYA6 745 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DNAJB3Q8WWF6 145 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TIFAQ96CG3 184 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UNC45AQ9H3U1 944 aa13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC37A4O43826 429 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PARNO95453 639 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CXCL10P02778 98 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PSAPP07602 524 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KRT76Q01546 638 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRIM29Q14134 588 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 Q4G0T1 1027 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.68□□□□□ -0.22
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms