RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	PROSER1	Q86XN7	944 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM129C	Q86XR2	697 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	NOX5	Q96PH1	765 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		6.28	□□□□□ -1.4
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284		H7C1D1	291 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC00310	P59036	64 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CD276	Q5ZPR3	534 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	STK32C	Q86UX6	486 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	OXSM	Q9NWU1	459 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	WASF3	Q9UPY6	502 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		6.27	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	RFXAP	O00287	272 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	DVL2	O14641	736 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CNGA1	P29973	690 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF11	P52732	1056 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ITGA1	P56199	1179 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	HERVK_113	P62684	666 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	FZD5	Q13467	585 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	DHCR24	Q15392	516 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	LIPI	Q6XZB0	460 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	KY	Q8NBH2	561 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	PWWP2A	Q96N64	755 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM209	Q96SK2	561 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	FOXP2	O15409	715 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	MME	P08473	750 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SDHA	P31040	664 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	HTRA3	P83110	453 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF174	Q15697	407 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	TTLL6	Q8N841	843 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	USP7	Q93009	1102 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSS2	Q9NR19	701 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD62	A6NC57	917 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF839	A8K0R7	811 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC9A1	P19634	815 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	IL2	P60568	153 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	PFKP	Q01813	784 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	STRN3	Q13033	797 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM9	Q13443	819 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	DTX3	Q8N9I9	347 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	FKBP9	O95302	570 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP17A1	P05093	508 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	BPI	P17213	487 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	AOAH	P28039	575 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	THBS2	P35442	1172 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	LSS	P48449	732 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	JAG1	P78504	1218 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	NFKB2	Q00653	900 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	OCRL	Q01968	901 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	EFHB	Q8N7U6	833 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	ASB15	Q8WXK1	588 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	CLIC6	Q96NY7	704 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	GBP4	Q96PP9	640 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	TTC1	Q99614	292 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	DLL4	Q9NR61	685 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRK-215	ENST00000498284	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		6.23	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.2 ms