RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.08■■□□□ 1.13
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USP40-217ENST00000496298 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.08■■□□□ 1.13
USP40-217ENST00000496298 SIP14410 1827 aa22.08■■□□□ 1.12
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USP40-217ENST00000496298 CCNE2O96020 404 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP40-217ENST00000496298 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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USP40-217ENST00000496298 AZI2Q9H6S1 392 aa22.07■■□□□ 1.12
USP40-217ENST00000496298 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.07■■□□□ 1.12
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USP40-217ENST00000496298 SQORQ9Y6N5 450 aa22■■□□□ 1.11
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