RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 AZI2Q9H6S1 392 aa8.52□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.52□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 EMSYQ7Z589 1322 aa8.52□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 CDH23Q9H251 3354 aa8.52□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 PTPRSQ13332 1948 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 ZBBXA8MT70 800 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 BACH1O14867 736 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 MSH4O15457 936 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 NBNO60934 754 aa8.51□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 GNAT1P11488 350 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 RFC2P35250 354 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 STAT5BP51692 787 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 IGBP1P78318 339 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 ADAM17P78536 824 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 PPFIA1Q13136 1202 aa8.51□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 TRPC6Q9Y210 931 aa8.51□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 SIP14410 1827 aa8.51□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.5□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.5□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 TCTN1Q2MV58 587 aa8.5□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 Q4G0T1 1027 aa8.5□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.5□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.5□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 SLC37A4O43826 429 aa8.49□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 ATP4AP20648 1035 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 CYP3A7P24462 503 aa8.49□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 GUCY1B3Q02153 619 aa8.49□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.49□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.49□□□□□ -1.05
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PATJ-211ENST00000493967 DNAJB3Q8WWF6 145 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 TNFRSF25Q93038 417 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 MBOAT7Q96N66 472 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 RIT2Q99578 217 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 PBX4Q9BYU1 374 aa8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PATJ-211ENST00000493967 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.49□□□□□ -1.05
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