RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 AZI2Q9H6S1 392 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRU-207ENST00000492954 TLL1O43897 1013 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 EFCAB14O75071 495 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 CCNE2O96020 404 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 IGBP1P78318 339 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 BICD2Q8TD16 824 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 CERS4Q9HA82 394 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 FAM26DQ5JW98 314 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 PRR16Q569H4 304 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 SCRN1Q12765 414 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 LENG9Q96B70 501 aa20.46■□□□□ 0.87
PTPRU-207ENST00000492954 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.46■□□□□ 0.87
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PTPRU-207ENST00000492954 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.45■□□□□ 0.86
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PTPRU-207ENST00000492954 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.45■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 KAT6AQ92794 2004 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 DTNBO60941 627 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 LPIN1Q14693 890 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 APBB2Q92870 758 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF302Q9NR11 478 aa20.44■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 M0R2N6 131 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 PFKFB2O60825 505 aa20.43■□□□□ 0.86
PTPRU-207ENST00000492954 USP11P51784 963 aa20.43■□□□□ 0.86
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