RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, humanhuman

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPB-208ENST00000492730 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 C6orf50Q9HD87 102 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TMOD4Q9NZQ9 345 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 NYAP2Q9P242 653 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.51□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L15C9J2P7 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L11C9JVI0 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L18D6R9N7 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L22D6RA61 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L19D6RCP7 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L20D6RJB6 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 F5H6K3 240 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 OPLAHO14841 1288 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 RHOBTB3O94955 611 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ALDH1A1P00352 501 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 GYPCP04921 128 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CYP2C8P10632 490 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TXKP42681 527 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KLK7P49862 253 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 LBX1P52954 281 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ERVK-24P63145 666 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ICA1Q05084 483 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KLRC3Q07444 240 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L24Q0WX57 530 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 STK4Q13043 487 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 PAK1Q13153 545 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 MOGSQ13724 837 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KCNB1Q14721 858 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CCDC96Q2M329 555 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TREML2Q5T2D2 321 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SLFN13Q68D06 897 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 DESI2Q9BSY9 194 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TRIM9Q9C026 710 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 VPS16Q9H269 839 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KCNJ18B7U540 433 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 LAD1O00515 517 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 MEIS2O14770 477 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ZBTB5O15062 677 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 MFAP3LO75121 409 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 NDUFB10O96000 172 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 GNA11P29992 359 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CASP14P31944 242 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 UBA7P41226 1012 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 EHHADHQ08426 723 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CRHR2Q13324 411 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KCNJ12Q14500 433 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TBC1D5Q92609 795 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 MBOAT7Q96N66 472 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 WDR24Q96S15 920 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 CPA4Q9UI42 421 aa6.49□□□□□ -1.37
C4BPB-208ENST00000492730 TMX2Q9Y320 296 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms