RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 GALNT17Q6IS24 598 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 PCYT2Q99447 389 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 TBC1D22BQ9NU19 505 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 DOCK5Q9H7D0 1870 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 MYOGP15173 224 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 USP11P51784 963 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 SEPT8Q92599 483 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.9■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 TLL1O43897 1013 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 PPFIA3O75145 1194 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 CA3P07451 260 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 IL17RAQ96F46 866 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDSP1-211ENST00000492545 DHX15O43143 795 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 APBB2Q92870 758 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBED2Q9BTP6 218 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 KAT6AQ92794 2004 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 INSRRP14616 1297 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 STK3Q13188 491 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ABHD15Q6UXT9 468 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 RAD9AQ99638 391 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPC6Q9Y210 931 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 CHD7Q9P2D1 2997 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS3O15072 1205 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 GJB5O95377 273 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 CCNE2O96020 404 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 AMHP03971 560 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 CTSHP09668 335 aa26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 POTEB3A0JP26 581 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 BACH1O14867 736 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PFKFB2O60825 505 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB103AP81534 67 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT76Q01546 638 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PLCB4Q15147 1175 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 TCTN1Q2MV58 587 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PRR16Q569H4 304 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 POTEBQ6S5H4 581 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.85■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 CHRNA1P02708 482 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 TAP1Q03518 808 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 SCRN1Q12765 414 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 IER5Q5VY09 327 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 HBP1O60381 514 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 XBP1P17861 261 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 IGBP1P78318 339 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 BLIDQ8IZY5 108 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 NME8Q8N427 588 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP8B4Q8TF62 1192 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF302Q9NR11 478 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 INSL6Q9Y581 213 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 EYSQ5T1H1 3165 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 STK36Q9NRP7 1315 aa26.83■■□□□ 1.89
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRE1Q14246 886 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 PDXDC2PQ6P474 469 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAJB3Q8WWF6 145 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 LENG9Q96B70 501 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 RIT2Q99578 217 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 SQORQ9Y6N5 450 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC80Q8N2C7 3258 aa26.82■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 GBF1Q92538 1859 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 M0R2N6 131 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 PSAPP07602 524 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 IGFBP4P22692 258 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MGAT3Q09327 533 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 SWSAP1Q6NVH7 229 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 USP38Q8NB14 1042 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 TBCKQ8TEA7 893 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 COL1A2P08123 1366 aa26.81■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 M0QZ92 97 aa26.8■■□□□ 1.88
CTDSP1-211ENST00000492545 CYP3A7P24462 503 aa26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms