RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	GJB6	O95452	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	COL6A2	P12110	1019 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	CR2	P20023	1033 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	GRK2	P25098	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	GRK3	P35626	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ETFB	P38117	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	RAC3	P60763	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	FXN	Q16595	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	DDAH1	O94760	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	C1S	P09871	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ETV4	P43268	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	TBR1	Q16650	682 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	OSBP2	Q969R2	916 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	DSE	Q9UL01	958 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	FGFR1	P11362	822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ACRV1	P26436	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	MCM7	P33993	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	STIL	Q15468	1287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	WNT9A	O14904	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	INHBC	P55103	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	GPR85	P60893	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952		Q6ZPA2	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	FGR	P09769	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	GNAT1	P11488	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	FOXL1	Q12952	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC3-222	ENST00000491952	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	SOD2	P04179	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	CEP72	Q9P209	647 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AGRP	O00253	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	MPIG6B	O95866	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	KRT4	P19013	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	COL10A1	Q03692	680 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	HGFAC	Q04756	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952		A0A087X1B8	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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