RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487269.1

FAM204A-208, Transcript of family with sequence similarity 204 member A, human

TSL 2

Gene FAM204A, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM204A-208	ENST00000487269	ZBTB43	O43298	467 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CDC45	O75419	566 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	LPIN1	Q14693	890 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	HLA-C	Q95604	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SI	P14410	1827 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	INSRR	P14616	1297 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ADCY7	P51828	1080 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	COG5	Q9UP83	839 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CCNE2	O96020	404 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ACTR2	P61160	394 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	MEIS1	O00470	390 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	ENPP3	O14638	875 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CD52	P31358	61 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SREBF1	P36956	1147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	APBB2	Q92870	758 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNB2	Q92953	911 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM86B1	E9PN63	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	MAFG	O15525	162 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	COL9A1	P20849	921 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	GPM6B	Q13491	265 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269		Q6ZUG5	572 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	BRF1	Q92994	677 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	NFASC	O94856	1347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
FAM204A-208	ENST00000487269	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269		H3BNC9	293 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	ATG7	O95352	703 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	KCNA5	P22460	613 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	STAT5B	P51692	787 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	KRT32	Q14532	448 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	PKN1	Q16512	942 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	PHKB	Q93100	1093 aa		13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
FAM204A-208	ENST00000487269	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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