RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 JADE2Q9NQC1 790 aa6.31□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 B4GALT3O60512 393 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 PLATP00750 562 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 CHGBP05060 677 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 SURF1Q15526 300 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 BRAPQ7Z569 592 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 JMYQ8N9B5 988 aa6.3□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 H0Y858 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMTOR5O43504 91 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF827Q17R98 1081 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 NUDT11Q96G61 164 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 SCDO00767 359 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 B4GALT4O60513 344 aa6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 ITGB3P05106 788 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 COL6A1P12109 1028 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 SPATS1Q496A3 300 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 CPZQ66K79 652 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGGTB-210ENST00000485459 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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RABGGTB-210ENST00000485459 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 HIP1RO75146 1068 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL18O94889 574 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGS1P23219 599 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.27□□□□□ -1.41
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RABGGTB-210ENST00000485459 HERVK_113P62684 666 aa6.25□□□□□ -1.41
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RABGGTB-210ENST00000485459 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.25□□□□□ -1.41
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RABGGTB-210ENST00000485459 MC4RP32245 332 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC23AQ15436 765 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGGTB-210ENST00000485459 BORCS6Q96GS4 357 aa6.24□□□□□ -1.41
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