RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483479.1

RPSAP29-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 29, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP29, Length 869 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP29-201ENST00000483479 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 PRR29P0C7W0 189 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 PLA2G4BP0C869 781 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CYP2B6P20813 491 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 HOXD10P28358 340 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 DPYDQ12882 1025 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ACVR2BQ13705 512 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 MCM6Q14566 821 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 LY6KQ17RY6 165 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 USP6NLQ92738 828 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ERO1AQ96HE7 468 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 TRIM47Q96LD4 638 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 TRIM9Q9C026 710 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 EXOC1Q9NV70 894 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 RGL1Q9NZL6 768 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 KCND2Q9NZV8 630 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.14□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 E9PMD0 336 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 FOXN1O15353 648 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SLITRK3O94933 977 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 LYPLA2O95372 231 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 GH1P01241 217 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 HSPA6P17066 643 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 NLRP12P59046 1061 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 HTRA3P83110 453 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SP2Q02086 613 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CUL4BQ13620 913 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 LAMC2Q13753 1193 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ECM1Q16610 540 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 MFSD14CQ5VZR4 134 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CNNM4Q6P4Q7 775 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 GPBP1Q86WP2 473 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 C4orf19Q8IY42 314 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SPATA20Q8TB22 786 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 STAMQ92783 540 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 FUCA2Q9BTY2 467 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 AZI2Q9H6S1 392 aa11.13□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 EMSYQ7Z589 1322 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 BIN1O00499 593 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SORBS3O60504 671 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ARIH2O95376 493 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 PPP1R2P41236 205 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SLC12A3P55017 1021 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 STIM1Q13586 685 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 KCNB1Q14721 858 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ANO6Q4KMQ2 910 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 KCNK18Q7Z418 384 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 LRRC15Q8TF66 581 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 FAM167AQ96KS9 214 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SPATA33Q96N06 139 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 KATNBL1Q9H079 304 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ZNF302Q9NR11 478 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 GJD2Q9UKL4 321 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.12□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 MYMKA6NI61 221 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 GPR25O00155 361 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 FKTNO75072 461 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ATG7O95352 703 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 IDEP14735 1019 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 ADCYAP1R1P41586 468 aa11.11□□□□□ -0.63
RPSAP29-201ENST00000483479 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms