RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB10Q96DT7 871 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 AZI2Q9H6S1 392 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.4■■□□□ 1.02
UPP1-211ENST00000482015 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 EPOPA6NHQ4 379 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CYP3A4P08684 503 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 INSRRP14616 1297 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 GNA11P29992 359 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PRDM6Q9NQX0 595 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa21.39■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 GJB5O95377 273 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CCNE2O96020 404 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CHRNA1P02708 482 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 STAT5BP51692 787 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 STK3Q13188 491 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 FAM26DQ5JW98 314 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 SEPT8Q92599 483 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TRPC6Q9Y210 931 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.38■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 ATG7O95352 703 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PLCB4Q15147 1175 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MCTP2Q6DN12 878 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 RAD9AQ99638 391 aa21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PTPRSQ13332 1948 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 AMHP03971 560 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 RPAINQ86UA6 219 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 BICD2Q8TD16 824 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa21.36■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CPLX1O14810 134 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 NLRP5P59047 1200 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MGAT3Q09327 533 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 PRR16Q569H4 304 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 ABHD15Q6UXT9 468 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 RSPH3Q86UC2 560 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.35■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 POTEB3A0JP26 581 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 BACH1O14867 736 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 EDIL3O43854 480 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 GHRP10912 638 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 KRT40Q6A162 431 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 POTEBQ6S5H4 581 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.34■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 LINC01553A4QN01 128 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CIITAP33076 1130 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 AIFM3Q96NN9 605 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MTCH2Q9Y6C9 303 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 CDY2AQ9Y6F7 541 aa21.33■■□□□ 1.01
UPP1-211ENST00000482015 MYO9BQ13459 2157 aa21.33■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 UPP2O95045 317 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 DEXIO95424 95 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 TMEM62Q0P6H9 643 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 GRB10Q13322 594 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 LPIN1Q14693 890 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 FAM160B1Q5W0V3 765 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 APBB2Q92870 758 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 LENG9Q96B70 501 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 ZNF302Q9NR11 478 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 INSL6Q9Y581 213 aa21.32■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 DTNBO60941 627 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SLC26A2P50443 739 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 SCRN1Q12765 414 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.31■■□□□ 1
UPP1-211ENST00000482015 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms