RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 KRT76Q01546 638 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PLCB4Q15147 1175 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 LRCH3Q96II8 777 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 LAMA3Q16787 3333 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 SLC37A4O43826 429 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PSMD10O75832 226 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 SELPP16109 830 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 GUCY1B3Q02153 619 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PPFIA1Q13136 1202 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 C8orf76Q96K31 380 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-211ENST00000480301 FGBP02675 491 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 RFC2P35250 354 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 MCM2P49736 904 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 GPNMBQ14956 572 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 GRIK4Q16099 956 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 RASIP1Q5U651 963 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 ZNF302Q9NR11 478 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 BACH1O14867 736 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 GAS7O60861 476 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 INSRRP14616 1297 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A2P50443 739 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 PSAPP07602 524 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 PFKMP08237 780 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 ATP4AP20648 1035 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 HERVK_113Q902F9 699 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 DISC1Q9NRI5 854 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 TRPC6Q9Y210 931 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 POTEB3A0JP26 581 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 WDR64B1ANS9 1081 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 THPOP40225 353 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 POTEBQ6S5H4 581 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 HAS1Q92839 578 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 CHMP2AO43633 222 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 JAK3P52333 1124 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 IGBP1P78318 339 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 MBTPS1Q14703 1052 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 FAM20AQ96MK3 541 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 SAMM50Q9Y512 469 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 SCN5AQ14524 2016 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 WNT7AO00755 349 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 NBNO60934 754 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 CXCL10P02778 98 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 SFNP31947 248 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 POTEDQ86YR6 584 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.64■■□□□ 1.38
ACTB-211ENST00000480301 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 TBX3O15119 743 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 HBP1O60381 514 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 CAND2O75155 1236 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 RSPH10BP0C881 870 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 RPAINQ86UA6 219 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-211ENST00000480301 RDM1Q8NG50 284 aa23.64■■□□□ 1.37
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