RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	INF2	Q27J81	1249 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	BACH1	O14867	736 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	MSH4	O15457	936 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	NBN	O60934	754 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	IGBP1	P78318	339 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	TRPC6	Q9Y210	931 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	ACTN1	P12814	892 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PLCB4	Q15147	1175 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	GJA10	Q969M2	543 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	CTSH	P09668	335 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	INSRR	P14616	1297 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PBX2	P40425	430 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	MBTPS1	Q14703	1052 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR81	Q562E7	1941 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	RSPH10B	P0C881	870 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJB2	P25686	324 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT76	Q01546	638 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	LETM2	Q2VYF4	491 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089		Q4G0T1	1027 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PBX4	Q9BYU1	374 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF302	Q9NR11	478 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	CXCL10	P02778	98 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP3A7	P24462	503 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	NR5A1	Q13285	461 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	TCTN1	Q2MV58	587 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC5A5	Q92911	643 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	POTEB3	A0JP26	581 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT2	P35908	639 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	RABEP1	Q15276	862 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	POTEB	Q6S5H4	581 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	SAMM50	Q9Y512	469 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FBXO18-208	ENST00000470089	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM205C	A6NFA0	338 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	CHMP2A	O43633	222 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	GAS7	O60861	476 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	RABGGTB	P53611	331 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	NEK8	Q86SG6	692 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	MBOAT7	Q96N66	472 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	RIT2	Q99578	217 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	PTPRS	Q13332	1948 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	CAND2	O75155	1236 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	PSAP	P07602	524 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC26A2	P50443	739 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM29	Q14134	588 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	TIFA	Q96CG3	184 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC37A4	O43826	429 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT40	Q6A162	431 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	SI	P14410	1827 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR64	B1ANS9	1081 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FBXO18-208	ENST00000470089	PSMD10	O75832	226 aa		33.1	■■■□□ 2.89

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