RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.76□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 NAPBQ9H115 298 aa14.76□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.76□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.76□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 FSCN2O14926 492 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 NR3C2P08235 984 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 WEE2P0C1S8 567 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RLBP1P12271 317 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 MGAT3Q09327 533 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SIX5Q8N196 739 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 PXMP2Q9NR77 195 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 PATJQ8NI35 1801 aa14.75□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ABCB11O95342 1321 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 FGF18O76093 207 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 PDHBP11177 359 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 GNAT1P11488 350 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 NOVP48745 357 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ZNF543Q08ER8 600 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CES5AQ6NT32 575 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CPVLQ9H3G5 476 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 HCSTQ9UBK5 93 aa14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 DSPP15924 2871 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 HIDE1A8MVS5 230 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SCG2P13521 617 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CD52P31358 61 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ADAM17P78536 824 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SP2Q02086 613 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ACAP1Q15027 740 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 12.7
HDAC6-217ENST00000469223 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 TMEM260Q9NX78 707 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.73□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ADRB1P08588 477 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 STAG3L1P0CL83 205 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 MTHFRP42898 656 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 IL31RAQ8NI17 732 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 CASP10Q92851 521 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 TCF25Q9BQ70 676 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 MAST4O15021 2626 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SDHBP21912 280 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RFX1P22670 979 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 ITIH3Q06033 890 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 COL26A1Q96A83 441 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 AAASQ9NRG9 546 aa14.71□□□□□ -0.05
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HDAC6-217ENST00000469223 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC6-217ENST00000469223 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.71□□□□□ -0.05
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HDAC6-217ENST00000469223 STK25O00506 426 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 SP9P0CG40 484 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HDAC6-217ENST00000469223 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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