RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 ACTR2P61160 394 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 GRB10Q13322 594 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 RSPH3Q86UC2 560 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 IL27Q8NEV9 243 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TTC28-204ENST00000468807 UPP2O95045 317 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PCYT2Q99447 389 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 C6orf50Q9HD87 102 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 INSL6Q9Y581 213 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 NFASCO94856 1347 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 LINC01553A4QN01 128 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 MEIS1O00470 390 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 CHRNA1P02708 482 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 GHRP10912 638 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 FAM26DQ5JW98 314 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ASB2Q96Q27 587 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 UIMC1Q96RL1 719 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 SLC26A6Q9BXS9 759 aa24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 INSRRP14616 1297 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 STAT5BP51692 787 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 APBB2Q92870 758 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 YME1L1Q96TA2 773 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 NID2Q14112 1375 aa24.8■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 RRN3P2A6NIE6 340 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 FAM86B1E9PN63 330 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 BACH1O14867 736 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PKN1Q16512 942 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 FBXL16Q8N461 479 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 SIP14410 1827 aa24.79■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ESYT2A0FGR8 921 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ADAMTS3O15072 1205 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 GNA11P29992 359 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 ERVK-21P61565 698 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PLCB4Q15147 1175 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 RUFY3Q7L099 469 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 RPAINQ86UA6 219 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 SUGCTQ9HAC7 445 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 CDY2AQ9Y6F7 541 aa24.78■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 LPXNO60711 386 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 TFF2Q03403 129 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 MGAT3Q09327 533 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 TOP1MTQ969P6 601 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.77■■□□□ 1.56
TTC28-204ENST00000468807 POTEB3A0JP26 581 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 CCNE2O96020 404 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 LPIN1Q14693 890 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 MCTP2Q6DN12 878 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 POTEBQ6S5H4 581 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 BICD2Q8TD16 824 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 ZNF577Q9BSK1 485 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 VPS54Q9P1Q0 977 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 MUC3AQ02505 3323 aa24.76■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 M0QZ92 97 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 CYP3A4P08684 503 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 IFNAR1P17181 557 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 NTRK3Q16288 839 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 IER5Q5VY09 327 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 FAM160B1Q5W0V3 765 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.75■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.74■■□□□ 1.55
TTC28-204ENST00000468807 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms