RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 BACE1P56817 501 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CDK17Q00537 523 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK7Q13164 816 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DSG2Q14126 1118 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN14Q15678 1187 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NFIL3Q16649 462 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC174Q6PII3 467 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DYMQ7RTS9 669 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GPBP1Q86WP2 473 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 RETREG2Q8NC44 543 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RASSF8Q8NHQ8 419 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD7Q92527 254 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KLRG1Q96E93 195 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 WNK4Q96J92 1243 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CEP63Q96MT8 703 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 REEP2Q9BRK0 252 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 VPS16Q9H269 839 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PANK4Q9NVE7 773 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MYPNQ86TC9 1320 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0U1RQJ8 604 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 B4DLN1 442 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 VWA5AO00534 786 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EPHB6O15197 1021 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 RAD21O60216 631 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 LMNB1P20700 586 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 LRRC41Q15345 812 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 EPHA7Q15375 998 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 NCAPH2Q6IBW4 605 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 KCNK17Q96T54 332 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRC-210ENST00000462363 JADE2Q9NQC1 790 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 RGL1Q9NZL6 768 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA2Q9UL42 364 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-210ENST00000462363 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.27□□□□□ -1.41
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