RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-209ENST00000437652 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.83■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TMEM260Q9NX78 707 aa29.83■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 TUBE1Q9UJT0 475 aa29.83■■■□□ 2.37
UBAP2L-209ENST00000437652 NFASCO94856 1347 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 ARP10275 920 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 IGBP1P78318 339 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 APOBRQ0VD83 1088 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 AP3B2Q13367 1082 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 KCNB2Q92953 911 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 YME1L1Q96TA2 773 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 NCOR1O75376 2440 aa29.82■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 DNAJB3Q8WWF6 145 aa29.81■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 BRF1Q92994 677 aa29.81■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 HLA-CQ95604 372 aa29.81■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MEIS1O00470 390 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 BMP1P13497 986 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 INSRRP14616 1297 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 HSPA4P34932 840 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SREBF1P36956 1147 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 STAT5BP51692 787 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 ACTR2P61160 394 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MARCH8Q5T0T0 291 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 FBXO22Q8NEZ5 403 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 PCYT2Q99447 389 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 TRPC6Q9Y210 931 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.8■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 GHRP10912 638 aa29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SIP14410 1827 aa29.79■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SCG2P13521 617 aa29.78■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 SAMD11Q96NU1 681 aa29.78■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 C6orf50Q9HD87 102 aa29.78■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 REC8O95072 547 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 PSMA5P28066 241 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 KCNQ1P51787 676 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MGAT3Q09327 533 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 IER5Q5VY09 327 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MCTP2Q6DN12 878 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 NIPA1Q7RTP0 329 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 CDY2AQ9Y6F7 541 aa29.77■■■□□ 2.36
UBAP2L-209ENST00000437652 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 LPIN1Q14693 890 aa29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 PLCB4Q15147 1175 aa29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 PLA2G4DQ86XP0 818 aa29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ATG7O95352 703 aa29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 RPS6KB1P23443 525 aa29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 EPC2Q52LR7 807 aa29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 IL17RAQ96F46 866 aa29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa29.75■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 POTEB3A0JP26 581 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 M0QZ92 97 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ENPP3O14638 875 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 BACH1O14867 736 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 GNA11P29992 359 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 SLC26A2P50443 739 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FBXO47Q5MNV8 452 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 POTEBQ6S5H4 581 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FBXL16Q8N461 479 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ZBTB10Q96DT7 871 aa29.74■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ESYT2A0FGR8 921 aa29.73■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 CYP3A4P08684 503 aa29.73■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 PTPROQ16827 1216 aa29.73■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM160B1Q5W0V3 765 aa29.73■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa29.73■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 TMEM192Q8IY95 271 aa29.73■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM86B1E9PN63 330 aa29.72■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FAM86B2P0C5J1 330 aa29.72■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 PKN1Q16512 942 aa29.72■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.72■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 SQORQ9Y6N5 450 aa29.72■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 GPM6BQ13491 265 aa29.71■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ABHD15Q6UXT9 468 aa29.71■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 NME8Q8N427 588 aa29.71■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FIBCD1Q8N539 461 aa29.71■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 PHKBQ93100 1093 aa29.71■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 H3BNC9 293 aa29.7■■■□□ 2.35
UBAP2L-209ENST00000437652 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms