RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

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Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF627Q7L945 461 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP28-201ENST00000435142 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
USP9YP28-201ENST00000435142 GPR27Q9NS67 375 aa6.72□□□□□ -1.33
USP9YP28-201ENST00000435142 MATN2O00339 956 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 MSCO60682 206 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 COL6A2P12110 1019 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 FOXL1Q12952 345 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SCYL1Q96KG9 808 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.71□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SUSD5O60279 629 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PCSK4Q6UW60 755 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 TLR9Q9NR96 1032 aa6.7□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 RAMP2O60895 175 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 CAPNS1P04632 268 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 NFYCQ13952 458 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PRRX2Q99811 253 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 ACOT7O00154 380 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 ARHGAP6O43182 974 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 GNAT1P11488 350 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 MAP4K2Q12851 820 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 VOPP1Q96AW1 172 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNJ15Q99712 375 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 DSEQ9UL01 958 aa6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 GRIA2P42262 883 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 ETV4P43268 484 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 EPHA5P54756 1037 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 TBR1Q16650 682 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 MSL2Q9HCI7 577 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 CEP72Q9P209 647 aa6.67□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 B2RBV5 119 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 GRK2P25098 689 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 LMO1P25800 156 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 GRK3P35626 688 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 HHEXQ03014 270 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 KCTD1Q719H9 257 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 CFHR4Q92496 578 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 TTPALQ9BTX7 342 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.66□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 DDAH1O94760 285 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 KRT4P19013 534 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 USP53Q70EK8 1073 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.65□□□□□ -1.34
USP9YP28-201ENST00000435142 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 LBX2Q6XYB7 198 aa6.64□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 USP30Q70CQ3 517 aa6.64□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.64□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 NELFAQ9H3P2 528 aa6.64□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 FOXN1O15353 648 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 DLX3O60479 287 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 RECKO95980 971 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 HMGCRP04035 888 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 PDE6AP16499 860 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 KCNQ1P51787 676 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 PPP2R2AP63151 447 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 GRM7Q14831 915 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 KIZQ2M2Z5 673 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 Q6ZPA2 131 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 IER2Q9BTL4 223 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 BMP5P22003 454 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 COL10A1Q03692 680 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 D2HGDHQ8N465 521 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9YP28-201ENST00000435142 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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