RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 FGD1P98174 961 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 MARCH8Q5T0T0 291 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 TMEM192Q8IY95 271 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 IL17RAQ96F46 866 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 TRPC6Q9Y210 931 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 COL4A6Q14031 1691 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 SMCO2A6NFE2 343 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 H3BNC9 293 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 CDC45O75419 566 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 INSRRP14616 1297 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 RCAN1P53805 252 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 MGAT3Q09327 533 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 AP3B2Q13367 1082 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 LPIN1Q14693 890 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 TIGD5Q53EQ6 642 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 CEP55Q53EZ4 464 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 IER5Q5VY09 327 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 FIBCD1Q8N539 461 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 BARHL2Q9NY43 387 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 M0QZ92 97 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 STXBP3O00186 592 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 ZNF76P36508 570 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 ACTR2P61160 394 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 FUT2Q10981 343 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 GPM6BQ13491 265 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 FBXO47Q5MNV8 452 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 TYW1BQ6NUM6 668 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 RASEFQ8IZ41 740 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 CYP2W1Q8TAV3 490 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 PGBD1Q96JS3 809 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 ANO3Q9BYT9 981 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 KCNA5P22460 613 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 SREBF1P36956 1147 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 SLC26A2P50443 739 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 STAT5BP51692 787 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 BANK1Q8NDB2 785 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 PCYT2Q99447 389 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 SQORQ9Y6N5 450 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-205ENST00000432588 MEIS1O00470 390 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 ENPP3O14638 875 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 ARP10275 920 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 CTNNB1P35222 781 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 SKAP1Q86WV1 359 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 POTEB3A0JP26 581 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 RB1P06400 928 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 CDC27P30260 824 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.541e-17■□□□□ 9.8
ACTB-205ENST00000432588 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 PLCB4Q15147 1175 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 FAM160B1Q5W0V3 765 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 MCTP2Q6DN12 878 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 POTEBQ6S5H4 581 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 TMEM260Q9NX78 707 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 BACH1O14867 736 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 ATG7O95352 703 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 CD52P31358 61 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 NME8Q8N427 588 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 SCG2P13521 617 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 BMPR1AP36894 532 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 PAK2Q13177 524 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-205ENST00000432588 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms