RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 SELPP16109 830 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 THPOP40225 353 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 IGBP1P78318 339 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SWSAP1Q6NVH7 229 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 NEK8Q86SG6 692 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM184AQ8NB25 1140 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC5A5Q92911 643 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPC6Q9Y210 931 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMM50Q9Y512 469 aa28.3■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 NRCAMQ92823 1304 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT76Q01546 638 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PLCB4Q15147 1175 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 GRIK4Q16099 956 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LRCH2Q5VUJ6 765 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM160B1Q5W0V3 765 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TNFRSF25Q93038 417 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 C8orf76Q96K31 380 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 MBOAT7Q96N66 472 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF302Q9NR11 478 aa28.29■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP2AO43633 222 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC37A4O43826 429 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 INSRRP14616 1297 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TMX3Q96JJ7 454 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 RIT2Q99578 217 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.28■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 RFC2P35250 354 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAM17P78536 824 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 RBL2Q08999 1139 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa28.27■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 LAMA3Q16787 3333 aa28.26■■■□□ 2.12
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEB3A0JP26 581 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 PSAPP07602 524 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEBQ6S5H4 581 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 HERVK_113Q902F9 699 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB10Q96DT7 871 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 UNC45AQ9H3U1 944 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 DISC1Q9NRI5 854 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 GABBR1Q9UBS5 961 aa28.26■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TET1Q8NFU7 2136 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 PSMD10O75832 226 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 GPNMBQ14956 572 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 CKAP2LQ8IYA6 745 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 IL27Q8NEV9 243 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR64B1ANS9 1081 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 PFKMP08237 780 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 CTSHP09668 335 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MARCH8Q5T0T0 291 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.24■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 RRN3P2A6NIE6 340 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBBXA8MT70 800 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MARCH6O60337 910 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 NBNO60934 754 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 RSPH10BP0C881 870 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP4AP20648 1035 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MCM2P49736 904 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC26A2P50443 739 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 RASIP1Q5U651 963 aa28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP2B1P20020 1258 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MBTPS1Q14703 1052 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MIER3Q7Z3K6 550 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP8B4Q8TF62 1192 aa28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HTATSF1-202ENST00000425695 HBP1O60381 514 aa28.21■■■□□ 2.11
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