RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP6O43182 974 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGB5P18084 799 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC63Q05C16 580 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ARSHQ5FYA8 562 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP135Q66GS9 1140 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 NSMFQ6X4W1 530 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TMEM139Q8IV31 216 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TSG101Q99816 390 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF146Q9NTX7 359 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ADM5C9JUS6 153 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CASP14P31944 242 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 DSG3P32926 999 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MTA1Q13330 715 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 COG2Q14746 738 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 DLK2Q6UY11 383 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RINLQ6ZS11 566 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TPH2Q8IWU9 490 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 DYDC2Q96IM9 177 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TAAR1Q96RJ0 339 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 HSD17B14Q9BPX1 270 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 UNC45AQ9H3U1 944 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.07□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 FRMPD4Q14CM0 1322 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 STX10O60499 249 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MFAP3LO75121 409 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 EYA4O95677 639 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 GYPCP04921 128 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 BCRP11274 1271 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 OAZ1P54368 228 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 VGLL4Q14135 290 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM14Q14142 442 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 GIT2Q14161 759 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PTPN14Q15678 1187 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CNGA4Q8IV77 575 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD7Q92527 254 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PANX2Q96RD6 677 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RMDN3Q96TC7 470 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RIT2Q99578 217 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 REEP2Q9BRK0 252 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RIPK3Q9Y572 518 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.06□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 B4DLN1 442 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CCP110O43303 1012 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 SLITRK3O94933 977 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MAP3K9P80192 1104 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MTMR1Q13613 665 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PGM5Q15124 567 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TKFCQ3LXA3 575 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MB21D1Q8N884 522 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 REPS2Q8NFH8 660 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 DRC1Q96MC2 740 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 CSADQ9Y600 493 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PQC6 194 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 KLHL33A6NCF5 533 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 DNM2P50570 870 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 EPHA7Q15375 998 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 PXMP2Q9NR77 195 aa11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms