RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CD52P31358 61 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 RILPL2Q969X0 211 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 TLR9Q9NR96 1032 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PER2O15055 1255 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PPFIA3O75145 1194 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 STAM2O75886 525 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 SDSP20132 328 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 GATMP50440 423 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PPFIA1Q13136 1202 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 RSPH3Q86UC2 560 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 SUSD6Q92537 303 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 TLE6Q9H808 572 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 FOXK2Q01167 660 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 SEC23AQ15436 765 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 GRIK4Q16099 956 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN21Q16825 1174 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ASCL5Q7RTU5 278 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 CYTH3O43739 400 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 MARK3P27448 753 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 ATP8B4Q8TF62 1192 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 KRT23Q9C075 422 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-201ENST00000404162 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 TRAF1Q13077 416 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PROB1E7EW31 1015 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 ATP9AO75110 1047 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 STAG3L1P0CL83 205 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 IGBP1P78318 339 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PADI3Q9ULW8 664 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 ERVFC1P60507 584 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 GRM4Q14833 912 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 DUSP6Q16828 381 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 NEK1Q96PY6 1258 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 SCG2P13521 617 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 S1PR5Q9H228 398 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 SQORQ9Y6N5 450 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 CACNA1HO95180 2353 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 KCNA2P16389 499 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 IER5Q5VY09 327 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB33Q86T24 672 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 NLRX1Q86UT6 975 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 APOL5Q9BWW9 433 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 TMX1Q9H3N1 280 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 DMDP11532 3685 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 PRR23AA6NEV1 266 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 INSRRP14616 1297 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 NUBP1P53384 320 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 UBE3AQ05086 875 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 KCNC3Q14003 757 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 GLG1Q92896 1179 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 HCSTQ9UBK5 93 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-201ENST00000404162 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms