RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 MLKLQ8NB16 471 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 PSAPP07602 524 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 IDEP14735 1019 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 SLC12A3P55017 1021 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 ACTR2P61160 394 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 LY6KQ17RY6 165 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 MAML3Q96JK9 1138 aa22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 MAP2K5Q13163 448 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 KCNB1Q14721 858 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 UVSSAQ2YD98 709 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB39O15060 712 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 GGPS1O95749 300 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 CYP11B2P19099 503 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 PSMC5P62195 406 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 UGCGQ16739 394 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 MORN1Q5T089 497 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 UNC13DQ70J99 1090 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-204ENST00000402096 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 RHOBTB3O94955 611 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ARIH2O95376 493 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 TTLL4Q14679 1199 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 IQCB1Q15051 598 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 VTA1Q9NP79 307 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 BACH1O14867 736 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SCFD2Q8WU76 684 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 GDAQ9Y2T3 454 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 PLCB2Q00722 1185 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 TINF2Q9BSI4 451 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 PANK4Q9NVE7 773 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 MYH11P35749 1972 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SMTNL1A8MU46 457 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ARSHQ5FYA8 562 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 METTL7BQ6UX53 244 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 C4orf19Q8IY42 314 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ARID2Q68CP9 1835 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 LYPLA2O95372 231 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CYP2B6P20813 491 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 RGS2P41220 211 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D8O95759 1140 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 FCGRTP55899 365 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 HPS3Q969F9 1004 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 REEP2Q9BRK0 252 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF302Q9NR11 478 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-204ENST00000402096 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms