RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 FCER1AP12319 257 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 GCKP35557 465 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PDXDC1Q6P996 788 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 BRINP3Q76B58 766 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ANAPC5Q9UJX4 755 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 TRPC6Q9Y210 931 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 MROH2AA6NES4 1674 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 USP17L5A8MUK1 530 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 NOP56O00567 594 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMD1Q99460 953 aa17.74■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CHUKO15111 745 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC1Q9BTT6 524 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CCPG1Q9ULG6 757 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 DEPDC5O75140 1603 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ZBTB5O15062 677 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 GUCY2CP25092 1073 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PPIP5K2O43314 1243 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SYDE2Q5VT97 1194 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 KAZNQ674X7 775 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CASC4Q6P4E1 433 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.73■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 NR3C1P04150 777 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMC4P43686 418 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX1Q13596 522 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PCIF1Q9H4Z3 704 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHA6Q9UN73 950 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 GMNCA6NCL1 334 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 E9PMD0 336 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 STAM2O75886 525 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PLA2G4AP47712 749 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ALCAMQ13740 583 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F22Q6NT55 531 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 GRIN1Q05586 938 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 NAALADL2Q58DX5 795 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SFR1Q86XK3 245 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.435e-7■■□□□ 13
CTDSP2-201ENST00000398073 RWDD2BP57060 319 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 UBXN2AP68543 259 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SARNPP82979 210 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF354CQ86Y25 554 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.431e-10■■■■■ 217.2
CTDSP2-201ENST00000398073 CEP95Q96GE4 821 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX24Q9Y343 169 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 FHOD1Q9Y613 1164 aa17.72■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 RPSAP08865 295 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 P4HA1P13674 534 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 MUM1L1Q5H9M0 696 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 STAG2Q8N3U4 1231 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 MMEP08473 750 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP2R2AP63151 447 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 RASA3Q14644 834 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 HOOK2Q96ED9 719 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 MYOM1P52179 1685 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 NCAPHQ15003 741 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM260Q9NX78 707 aa17.71■□□□□ 0.43
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF185O15231 689 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINB2P05120 415 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 PIK3CAP42336 1068 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 LLGL1Q15334 1064 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 NEDD1Q8NHV4 660 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 CCHCR1Q8TD31 782 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 IL17RAQ96F46 866 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP57Q96MR6 1250 aa17.71■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 RNF8O76064 485 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 NLRP14Q86W24 1093 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 CSRNP1Q96S65 589 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 C7orf25Q9BPX7 421 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 TXLNGQ9NUQ3 528 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 TRIM10Q9UDY6 481 aa17.7■□□□□ 0.42
CTDSP2-201ENST00000398073 DAPK3O43293 454 aa17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms