RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379388.6

HIVEP1-201, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-201ENST00000379388 ADM5C9JUS6 153 aa12.87□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 F5H423 210 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa12.87□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GPT2Q8TD30 523 aa12.87□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 FAM151AQ8WW52 585 aa12.87□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 KRT15P19012 456 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PHKA2P46019 1235 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 AP3B2Q13367 1082 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 TXNRD3Q86VQ6 643 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GDAP1Q8TB36 358 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 AFG1LQ8WV93 481 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 TMEM143Q96AN5 459 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF233A6NK53 670 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 H2AFZP0C0S5 128 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 RARBP10826 455 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MXI1P50539 228 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MICALCLQ6ZW33 695 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 H2AFVQ71UI9 128 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PTF1AQ7RTS3 328 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 HAUS1Q96CS2 278 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ZWILCHQ9H900 591 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GCNT4Q9P109 453 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 CASP14P31944 242 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 THEM5Q8N1Q8 247 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 HSPH1Q92598 858 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 CYP27A1Q02318 531 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 CPLX4Q7Z7G2 160 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 NEDD1Q8NHV4 660 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SCYL1Q96KG9 808 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 CALN1Q9BXU9 219 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 KCNQ5Q9NR82 932 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SLC9A2Q9UBY0 812 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 C6orf163Q5TEZ5 329 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 HAUS2Q9NVX0 235 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 CETPP11597 493 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 CXCL9Q07325 125 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.86□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MAPK4P31152 587 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 C1orf228Q6PIY5 440 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PPM1EQ8WY54 764 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GCLMP48507 274 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 LRRC71Q8N4P6 559 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 RNF149Q8NC42 400 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MTMR4Q9NYA4 1195 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ABCA9Q8IUA7 1624 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 LXNQ9BS40 222 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ABCC12Q96J65 1359 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 KRIT1O00522 736 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 KCNJ6P48051 423 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 FBXO41Q8TF61 875 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 UBN1Q9NPG3 1134 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 RSPH14Q9UHP6 348 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 TRIM49BA6NDI0 452 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ADORA2BP29275 332 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 LMCD1Q9NZU5 365 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ESYT2A0FGR8 921 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ECE1P42892 770 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SMYD2Q9NRG4 433 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 SGK1O00141 431 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MYO1FO00160 1098 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PGK2P07205 417 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 STAT5BP51692 787 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PPFIA1Q13136 1202 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ACER1Q8TDN7 264 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MIS12Q9H081 205 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.85□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 EHHADHQ08426 723 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 NFIAQ12857 509 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GNASQ5JWF2 1037 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ELMOD1Q8N336 334 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 KRT12Q99456 494 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 GPC3P51654 580 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 STK17AQ9UEE5 414 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 PRR12Q9ULL5 1215 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 ENC1O14682 589 aa12.84□□□□□ -0.35
HIVEP1-201ENST00000379388 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms