RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 FAM187AA6NFU0 413 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 E7EWF7 191 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 SPAG6O75602 509 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CA4P22748 312 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CEP95Q96GE4 821 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 TNKSO95271 1327 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 PDHA1P08559 390 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 TOM1L1O75674 476 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 KRT6AP02538 564 aa5.91□□□□□ -1.46
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PTPRB-202ENST00000334414 KRT6CP48668 564 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 TMPRSS15P98073 1019 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 STAT4Q14765 748 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 CCDC127Q96BQ5 260 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 FANCEQ9HB96 536 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRB-202ENST00000334414 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.91□□□□□ -1.46
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