RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TMEM54-201ENST00000329151 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.64■■□□□ 1.86
TMEM54-201ENST00000329151 H3BNC9 293 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 KRT32Q14532 448 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 BANK1Q8NDB2 785 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 OSBPL7Q9BZF2 842 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.62■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 INSRRP14616 1297 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 LPIN1Q14693 890 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 FAM50BQ9Y247 325 aa26.61■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 COL4A6Q14031 1691 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 MYO7AQ13402 2215 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 LEXMQ3ZCV2 418 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 ANO3Q9BYT9 981 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 NFASCO94856 1347 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa26.6■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 SMCO2A6NFE2 343 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 STAT5BP51692 787 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 ACTR2P61160 394 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 MGAT3Q09327 533 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 AP3B2Q13367 1082 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 CEP55Q53EZ4 464 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 PGBD1Q96JS3 809 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 TTC3P53804 2025 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 BACH1O14867 736 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 RB1P06400 928 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 TRPV2Q9Y5S1 764 aa26.58■■□□□ 1.85
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 ENPP3O14638 875 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 CDC45O75419 566 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM31Q5JXX7 168 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 BARHL2Q9NY43 387 aa26.57■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 NCK2O43639 380 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 CD52P31358 61 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 SLC26A2P50443 739 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 PAK2Q13177 524 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 TCEAL5Q5H9L2 206 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 MARCH8Q5T0T0 291 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 LMAN2LQ9H0V9 348 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 EPHX3Q9H6B9 360 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 SQORQ9Y6N5 450 aa26.56■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 POTEB3A0JP26 581 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 STXBP3O00186 592 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 STAG3L1P0CL83 205 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 ARP10275 920 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 BMPR1AP36894 532 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM62Q0P6H9 643 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 PLCB4Q15147 1175 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 POTEBQ6S5H4 581 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 CYP2W1Q8TAV3 490 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 CLDND1Q9NY35 253 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa26.55■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 SREBF1P36956 1147 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 GJD3Q8N144 294 aa26.54■■□□□ 1.84
TMEM54-201ENST00000329151 PPP2R3CQ969Q6 453 aa26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms