RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CFLARO15519 480 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SRGAP2O75044 1071 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KC1Q96S38 1066 aa26.03■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MORC4Q8TE76 937 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC188H7C350 402 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 LIFRP42702 1097 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB17Q13105 803 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPSAP2O60256 369 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAIPQ9BWF2 469 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 TADA3O75528 432 aa26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCD1P33897 745 aa26.01■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF207Q6ZRF8 634 aa26.01■■□□□ 1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 DCTN3O75935 186 aa26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6B2Q6IFH4 312 aa26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 RHOT2Q8IXI1 618 aa26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM21Q9UKJ8 722 aa26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PITPNM3Q9BZ71 974 aa26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa26.01■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GGCXP38435 758 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 TADA2BQ86TJ2 420 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CD58P19256 250 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB33Q86T24 672 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GDAQ9Y2T3 454 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO1CO00159 1063 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PODXLO00592 558 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GDF11O95390 407 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 KANSL2Q9H9L4 492 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CCND2P30279 289 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SYDE2Q5VT97 1194 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPKQ9BS16 269 aa26■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 TMED1Q13445 227 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 NVLO15381 856 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 LMNAP02545 664 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L8P0C7I0 530 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP3P12645 472 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PDIK1LQ8N165 341 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT82Q9NSB4 513 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 MID2Q9UJV3 735 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDCD1Q96RS6 583 aa25.99■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CYTH2Q99418 400 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SPARCL1Q14515 664 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP72Q9P209 647 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-7P63135 1459 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD65E5RJM6 399 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 APBA3O96018 575 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 FGD4Q96M96 766 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF22Q14807 665 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0G2JND7 137 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SASH1O94885 1247 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 STAT2P52630 851 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GRAMD1BQ3KR37 738 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 ZWILCHQ9H900 591 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX24Q9Y343 169 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 KDM5CP41229 1560 aa25.97■■□□□ 1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms