RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273347.9

NXPE3-201, Transcript of neurexophilin and PC-esterase domain family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NXPE3, Length 3,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3-201ENST00000273347 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZBTB39O15060 712 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SFR1Q86XK3 245 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ACER1Q8TDN7 264 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 A0A087X0T9 212 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FAM228BP0C875 321 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ACTN1P12814 892 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 TRIM58Q8NG06 486 aa14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SLC15A2Q16348 729 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 TRAF5O00463 557 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZMYND10O75800 440 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SLITRK3O94933 977 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 USH1GQ495M9 461 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SIP14410 1827 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SERPING1P05155 500 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 CASP4P49662 377 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 KIF5AQ12840 1032 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 NAB2Q15742 525 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FBXO11Q86XK2 927 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SLC5A5Q92911 643 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FAM20AQ96MK3 541 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.92□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 KLRC1P26715 233 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PON1P27169 355 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 KCNH2Q12809 1159 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PPP2R5CQ13362 524 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 NEK11Q8NG66 645 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 BMP3P12645 472 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SLC9A1P19634 815 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF131P52739 623 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RASSF7Q02833 373 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SLC18A3Q16572 532 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 NFIL3Q16649 462 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 CCDC65Q8IXS2 484 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SLC35C1Q96A29 364 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RGL1Q9NZL6 768 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ATP8B3O60423 1300 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 TNFRSF8P28908 595 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RINT1Q6NUQ1 792 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZBTB9Q96C00 473 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 CRACR2AQ9BSW2 395 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 TMX2Q9Y320 296 aa14.91□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 GNA14O95837 355 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 SPDYE6P0CI01 402 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 POLD4Q9HCU8 107 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF536O15090 1300 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 KCNA3P22001 575 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 MAP3K10Q02779 954 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 EXOC4Q96A65 974 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 TSG101Q99816 390 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PPP1R37O75864 691 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 ADAM9Q13443 819 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 MS4A14Q96JA4 679 aa14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NXPE3-201ENST00000273347 PDXKO00764 312 aa14.89□□□□□ -0.03
NXPE3-201ENST00000273347 EYA4O95677 639 aa14.89□□□□□ -0.03
NXPE3-201ENST00000273347 CXCR5P32302 372 aa14.89□□□□□ -0.03
NXPE3-201ENST00000273347 MAPK7Q13164 816 aa14.89□□□□□ -0.03
NXPE3-201ENST00000273347 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.89□□□□□ -0.03
NXPE3-201ENST00000273347 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
NXPE3-201ENST00000273347 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms