RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264694.12

SNX25-201, Transcript of sorting nexin 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SNX25, Length 3,264 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25-201ENST00000264694 SLC9A1P19634 815 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 C12orf60Q5U649 245 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 SPAG5Q96R06 1193 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 NR2E1Q9Y466 385 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.49□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 C5orf60A6NFR6 353 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 F8VZ95 297 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CLTAP09496 248 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 SBK1Q52WX2 424 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 KRT79Q5XKE5 535 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PEX26Q7Z412 305 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.091e-8■□□□□ 10.6
SNX25-201ENST00000264694 PANK4Q9NVE7 773 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 GGT7Q9UJ14 662 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 GNA11P29992 359 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 XRCC4Q13426 336 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PPP2R5AQ15172 486 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ERFEQ4G0M1 354 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 COA7Q96BR5 231 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PBKQ96KB5 322 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 NOD2Q9HC29 1040 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.48□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TRIM37O94972 964 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CAMTA2O94983 1202 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MTMR9Q96QG7 549 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 GANQ9H2C0 597 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MYH1P12882 1939 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 A0A1B0GUL6 1792 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ATP6V1G2O95670 118 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CHN1P15882 459 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 KCNH2Q12809 1159 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MTMR3Q13615 1198 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 DAAM2Q86T65 1068 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CCDC197Q8NCU1 140 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MTFR1LQ9H019 292 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.47□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 E9PMD0 336 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MMEP08473 750 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 IFNAR2P48551 515 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TNNI2P48788 182 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PROM2Q8N271 834 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 C3orf20Q8ND61 904 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 NAGPAQ9UK23 515 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MARCH6O60337 910 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PAEPP09466 180 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MYO1EQ12965 1108 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ADAM9Q13443 819 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 PARP10Q53GL7 1025 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 BRINP3Q76B58 766 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SNX25-201ENST00000264694 BCL9O00512 1426 aa14.46□□□□□ -0.1
SNX25-201ENST00000264694 MGRN1O60291 552 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms