RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 NR1D1P20393 614 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SLCO1A2P46721 670 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SEPT2Q15019 361 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 CEP72Q9P209 647 aa14.67□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA8KD6RF30 607 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 KRT71Q3SY84 523 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SLFN13Q68D06 897 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 MSL1Q68DK7 614 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GCNT4Q9P109 453 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 NOL4O94818 638 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 CORO7P57737 925 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ADCY1Q08828 1119 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 HGSNATQ68CP4 663 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SLF2Q8IX21 1173 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF233A6NK53 670 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 PPP1R2P41236 205 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.9
TMOD1-201ENST00000259365 RHBDL3P58872 404 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC19Q96DA6 116 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ANO3Q9BYT9 981 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.66□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 LRP6O75581 1613 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GRID2IPA4D2P6 1211 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 TTI1O43156 1089 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 FAM13AO94988 1023 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF543Q08ER8 600 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 SLC18A3Q16572 532 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 VPS36Q86VN1 386 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 REEP2Q9BRK0 252 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PQJ5 194 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 ZBTB5O15062 677 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 MYZAPP0CAP1 466 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 CYP11B2P19099 503 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 EMBQ6PCB8 327 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.65□□□□□ -0.06
TMOD1-201ENST00000259365 CHD4Q14839 1912 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 FGGP02679 453 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 UCHL3P15374 230 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 FLT3P36888 993 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 COG2Q14746 738 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 CEP57Q86XR8 500 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 MDM1Q8TC05 714 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 H2AFZP0C0S5 128 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 AADACL2Q6P093 401 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 H2AFVQ71UI9 128 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 ANKS1AQ92625 1134 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 SORBS3O60504 671 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 AKAP3O75969 853 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 IFNAR2P48551 515 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 PLTPP55058 493 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 PPP4CP60510 307 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 NAB2Q15742 525 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 GLG1Q92896 1179 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.64□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGAP4P98171 946 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 MGARPQ8TDB4 240 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 GGT7Q9UJ14 662 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.63□□□□□ -0.07
TMOD1-201ENST00000259365 MYH3P11055 1940 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms