RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259003.14

CSHL1-201, Transcript of chorionic somatomammotropin hormone like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSHL1, Length 739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1-201ENST00000259003 PPFIA1Q13136 1202 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 GRIK4Q16099 956 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TTC22Q5TAA0 569 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 APBB2Q92870 758 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 LY9Q9HBG7 655 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 NRCAMQ92823 1304 aa14.58□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MRE11P49959 708 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 NCOA7Q8NI08 942 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 STAM2O75886 525 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 DGKIO75912 1065 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ITGB1P05556 798 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RNF135Q8IUD6 432 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PGBD1Q96JS3 809 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 HCSTQ9UBK5 93 aa14.56□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ERICH2A1L162 156 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PIK3CDO00329 1044 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 GLP2RO95838 553 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RB1P06400 928 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 INSRRP14616 1297 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ADAM15Q13444 863 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SPPL3Q8TCT6 385 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TMX1Q9H3N1 280 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CLEC1BQ9P126 229 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 USP34Q70CQ2 3546 aa14.55□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SGSM2O43147 1006 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MGEA5O60502 916 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MMP1P03956 469 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 IER5LQ5T953 404 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TAF2Q6P1X5 1199 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 NLRX1Q86UT6 975 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 GLG1Q92896 1179 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CUL5Q93034 780 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 GPRASP2Q96D09 838 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CD207Q9UJ71 328 aa14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 STXBP3O00186 592 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PPFIA3O75145 1194 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 ARP10275 920 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TRAF1Q13077 416 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 MAP4K1Q92918 833 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PADI3Q9ULW8 664 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CSHL1-201ENST00000259003 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 PER2O15055 1255 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 PRC1O43663 620 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 NRIP1P48552 1158 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 NDUFV1P49821 464 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 MTMR1Q13613 665 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 PLCB4Q15147 1175 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.52□□□□□ -0.09
CSHL1-201ENST00000259003 PRSS33Q8NF86 280 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms