RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 GLG1Q92896 1179 aa23.78■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.78■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 H3BQV1 296 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 CHMP2AO43633 222 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 CYP2C9P11712 490 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 MCTP1Q6DN14 999 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.77■■□□□ 1.4
COX5B-201ENST00000258424 HOXC8P31273 242 aa23.76■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.76■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.76■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 VAV3Q9UKW4 847 aa23.76■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.76■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TBX3O15119 743 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 NEMFO60524 1076 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 STAT5BP51692 787 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 FPGSQ05932 587 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 NBR1Q14596 966 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PTGISQ16647 500 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 FAM20AQ96MK3 541 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 FAM161BQ96MY7 647 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 AZI2Q9H6S1 392 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.75■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 WDR64B1ANS9 1081 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 BACH1O14867 736 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TIMP1P01033 207 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MCM7P33993 719 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 EPHB4P54760 987 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TTC38Q5R3I4 469 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 ZNF302Q9NR11 478 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 DISC1Q9NRI5 854 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SETD4Q9NVD3 440 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SAMM50Q9Y512 469 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.74■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PSAPP07602 524 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 ATP4AP20648 1035 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PLCB4Q15147 1175 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 ZNF174Q15697 407 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 CALCRLQ16602 461 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 HIPK3Q9H422 1215 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.73■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SCN5AQ14524 2016 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 EML1O00423 815 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SYT1P21579 422 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 CYP2C18P33260 490 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TRAPPC10P48553 1259 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 JAK3P52333 1124 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 ADAM17P78536 824 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PPP2R5CQ13362 524 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 UGCGQ16739 394 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 LMBR1Q8WVP7 490 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 WNT8BQ93098 351 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 GUCD1Q96NT3 240 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MTMR9Q96QG7 549 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 GABBR1Q9UBS5 961 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 NOD1Q9Y239 953 aa23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MARCH6O60337 910 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PDCP20941 246 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SFNP31947 248 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PPFIA1Q13136 1202 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 MFSD5Q6N075 450 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 COL6A3P12111 3177 aa23.71■■□□□ 1.39
COX5B-201ENST00000258424 TREHO43280 583 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 ZNF862O60290 1169 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 SLC26A2P50443 739 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 GRIK4Q16099 956 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 RDM1Q8NG50 284 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 TRPC6Q9Y210 931 aa23.7■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 NRCAMQ92823 1304 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 POTEB3A0JP26 581 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 DLL1O00548 723 aa23.69■■□□□ 1.38
COX5B-201ENST00000258424 INSRRP14616 1297 aa23.69■■□□□ 1.38
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