RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 LRRIQ4A6NIV6 560 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GUCY1A3Q02108 690 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ANO3Q9BYT9 981 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 FLT1P17948 1338 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 H7C1D1 291 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MOCS3O95396 460 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 KLK7P49862 253 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TROAPQ12815 778 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SPP2Q13103 211 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NEDD9Q14511 834 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NLRX1Q86UT6 975 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SAR1BQ9Y6B6 198 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 E7EVH7 732 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 AP1G2O75843 785 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CSPG5O95196 566 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RASA1P20936 1047 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 STK4Q13043 487 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SNX1Q13596 522 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NCAPHQ15003 741 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 HOOK2Q96ED9 719 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PSD3Q9NYI0 1048 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TMOD4Q9NZQ9 345 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.32□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MAP2K7O14733 419 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 IRF6O14896 467 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 HSF2BPO75031 334 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GFPT2O94808 682 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PLA2G4BP0C869 781 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 DNM2P50570 870 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 STAT2P52630 851 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PLA2G12BQ9BX93 195 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 LRP5O75197 1615 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ABCB11O95342 1321 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TTC26A0AVF1 554 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NPR1P16066 1061 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 VAV2P52735 878 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZNF394Q53GI3 561 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MASTLQ96GX5 879 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 COA1Q9GZY4 146 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ESYT3A0FGR9 886 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 PEX26Q7Z412 305 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TTLL6Q8N841 843 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 TC2NQ8N9U0 490 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RNF169Q8NCN4 708 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NOX5Q96PH1 765 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.31□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 IKBKBO14920 756 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 NCK2O43639 380 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 STX10O60499 249 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZBED4O75132 1171 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 IFNB1P01574 187 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 MYBL2P10244 700 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ECE1P42892 770 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ASPRV1Q53RT3 343 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.3□□□□□ -1.08
USPL1-201ENST00000255304 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms