RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 AMNQ9BXJ7 453 aa20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 LIG3P49916 1009 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CYP11B2P19099 503 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PSMC6P62333 389 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 VPS72Q15906 364 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ARL8AQ96BM9 186 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 COA1Q9GZY4 146 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GFPT2O94808 682 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GLI1P08151 1106 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 RGL1Q9NZL6 768 aa20.2■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 RPS6KA5O75582 802 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GBP6Q6ZN66 633 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 KRIT1O00522 736 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PTK2Q05397 1052 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CCDC174Q6PII3 467 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GCNT4Q9P109 453 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 MYBP10242 640 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CORO7P57737 925 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GYS1P13807 737 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 REEP2Q9BRK0 252 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 H2AFZP0C0S5 128 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 RSPH10BP0C881 870 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 IRAK1P51617 712 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 H2AFVQ71UI9 128 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CCDC17Q96LX7 622 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 DPH5Q9H2P9 285 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GJB7Q6PEY0 223 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 SHMT1P34896 483 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CASP5P51878 434 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ZIM3Q96PE6 472 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 BCS1LQ9Y276 419 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 F5H6K3 240 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CRKP46108 304 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 KLRC3Q07444 240 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 NAB2Q15742 525 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TLR2O60603 784 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 UCHL3P15374 230 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.821e-8■■□□□ 13.2
LRP3-201ENST00000253193 MSL1Q68DK7 614 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 DOCK2Q92608 1830 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 FAM153BP0C7A2 387 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 FAM153CQ494X1 144 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ALS2CLQ60I27 953 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 SMIM23A6NLE4 172 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PRLRP16471 622 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 STAT1P42224 750 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 KSR1Q8IVT5 923 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CERS5Q8N5B7 392 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 RNF14Q9UBS8 474 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 SNED1Q8TER0 1413 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 NR3C1P04150 777 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TRIM37O94972 964 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 HGSNATQ68CP4 663 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 BCORQ6W2J9 1755 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 KRT13P13646 458 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 CASP4P49662 377 aa20.15■□□□□ 0.82
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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