RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 PCP11498 1178 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 GUCY2CP25092 1073 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 IQCKQ8N0W5 287 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 SPICE1Q8N0Z3 855 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB34Q9BZG1 259 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PSTPIP2Q9H939 334 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RGL1Q9NZL6 768 aa19■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MED24O75448 989 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 GCNT3O95395 438 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PRPHP41219 470 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC18A3Q16572 532 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PTGISQ16647 500 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MTMR9Q96QG7 549 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 NAB2Q15742 525 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ALS2CLQ60I27 953 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CPLX4Q7Z7G2 160 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 USP38Q8NB14 1042 aa18.99■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MDH1P40925 334 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 GPSM2P81274 684 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKS1AQ92625 1134 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 HAUS2Q9NVX0 235 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CEP72Q9P209 647 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 FGGP02679 453 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM49P0CI25 452 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM49CP0CI26 452 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 POLD1P28340 1107 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CYP2J2P51589 502 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 TNNC1P63316 161 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MCTP2Q6DN12 878 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM212AQ96EL1 285 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CABS1Q96KC9 395 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 JMJD4Q9H9V9 463 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CACNA1SQ13698 1873 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 LAD1O00515 517 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 COG2Q14746 738 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CUEDC2Q9H467 287 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 SNX24Q9Y343 169 aa18.98■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CETN3O15182 167 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PLTPP55058 493 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 EPN3Q9H201 632 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ACP6Q9NPH0 428 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CLSTN1O94985 981 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC63Q05C16 580 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 EXOC3L4Q17RC7 722 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC121Q6ZUS5 278 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PNMA2Q9UL42 364 aa18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF4AO95239 1232 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MYL1P05976 194 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 DISP2A7MBM2 1401 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 UCHL3P15374 230 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 GDF3Q9NR23 364 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 SHBGP04278 402 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC14Q15048 493 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CYFIP2Q96F07 1278 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 CD209Q9NNX6 404 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 GCNT4Q9P109 453 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.96■□□□□ 0.63
KCNQ1-201ENST00000155840 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-201ENST00000155840 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-201ENST00000155840 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-201ENST00000155840 AKAP3O75969 853 aa18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-201ENST00000155840 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
KCNQ1-201ENST00000155840 SETQ01105 290 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms