RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027157.9

Rpe-201, Transcript of Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rpe, Length 2,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe-201ENSMUST00000027157 Sulf1Q8K007 870 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpe-201ENSMUST00000027157 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Rpe-201ENSMUST00000027157 Apopt1Q9CQW7 192 aa14.65□□□□□ -0.06
Rpe-201ENSMUST00000027157 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ttc38A3KMP2 465 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ace3D0G895 737 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Apol10bG3X9K7 334 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Vmn2r78K7N6U5 853 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Stra6O70491 670 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pik3r1P26450 724 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Trim43cP86449 446 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Shc3Q61120 474 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tsg101Q61187 391 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Chtf18Q8BIW9 969 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 PdgfdQ925I7 370 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tmod4Q9JLH8 345 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Hebp1Q9R257 190 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 DexiQ9WUQ7 95 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gm10436L7N1Y3 520 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 SpibO35906 267 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Lig1P37913 916 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rit2P70425 217 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Epn1Q80VP1 575 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Hsdl1Q8BTX9 330 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Dlk2Q8K1E3 382 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pcdhb12Q91Y07 789 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Lpin2Q99PI5 893 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Egfl6Q9JJZ5 550 aa14.64□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Meis3P97368 378 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pla2g6P97819 807 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fgfr4Q03142 799 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rbm41Q8JZV4 413 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ddx39aQ8VDW0 427 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Kif17Q99PW8 1038 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 CutaQ9CQ89 177 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Vta1Q9CR26 309 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Dnajc18Q9CZJ9 357 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fsip1Q9D3V5 435 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gm1993A6X8I0 212 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gm4907B1AXB9 411 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 SlxD3Z347 212 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 SarsP26638 512 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ttc26Q8BS45 554 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gys2Q8VCB3 704 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fam205aA2APU8 1308 aa14.63□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Magea10A2AMW4 325 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Trappc11B2RXC1 1133 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Jakmip2D3YXK0 820 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Erbb2P70424 1256 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Kcnma1Q08460 1209 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ece1Q4PZA2 769 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Znf354cQ571J5 560 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Atp13a4Q5XF90 1193 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Srd5a1Q68FF9 255 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rcor2Q8C796 523 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Btbd7Q8CFE5 1130 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Angel2Q8K1C0 544 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 YwhabQ9CQV8 246 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ttll6A4Q9E8 822 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 NpcdF8VQB8 469 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gm8298J3QPI0 401 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tpm1P58771 284 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Dcaf17Q3TUL7 519 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Senp5Q6NXL6 749 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 TbataQ7TSD4 393 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Mrpl58Q8R035 206 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Mov10l1Q99MV5 1187 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tmem39aQ9CYC3 486 aa14.62□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Barx2O08686 283 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Mdm4O35618 489 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Trim25Q61510 634 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pank4Q80YV4 820 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Pgm5Q8BZF8 567 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tmx2Q9D710 295 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ccdc89Q9DA73 370 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Trip11E9Q512 1976 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tpm2P58774 284 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Ppp1r13bQ62415 1087 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Rab3il1Q8VDV3 383 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Fam217aQ9D9W6 419 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Tpcn1Q9EQJ0 817 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa14.61□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Rpe-201ENSMUST00000027157 Gng11P61953 73 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 100.6 ms